1254年，蒙古大汗忽必烈派兵攻取鄯阐城。1276年（元至元十三年），蒙元设立云南行中书省，为全国13行省之一，首府为中庆（昆明），自此昆明取代大理成为云南的政治中心。

1910年，法国修筑的滇越铁路（今称昆河铁路）通车，从此昆明可以通过越南转经海路，到达中国其他省份。
同年，商办耀龙电灯公司引进德国水轮发电机2台共480千瓦，聘请德国工程师，在滇池惟一出水口螳螂川石龙坝，修建中国第一座水力发电站——石龙坝水电站。
1912年4月，电站正式向昆明供电。

1)民国时期：
1911年10月30日，滇军将领蔡锷、唐继尧在昆明发动重九起义，宣布云南独立。
1915年12月25日， 唐继尧、蔡锷、李烈钧等人宣布云南起义（护国运动），反对袁世凯称帝，编组护国军出师讨伐。

2) 二战时期：
昆明成为抗战大后方，成为当时中国的希望之城，滇缅公路，堪称中国的抗日战争“生命线”。
为保证抗战物资的输入，必须尽快开辟由缅甸进入中国云南昆明的滇缅公路。
1937年11月，经当时的中央政府批准，云南修建滇缅公路。
经全省人民特别是17万筑路民工艰苦努力，1938年8月滇缅公路提前完工，成为抗战期间中国接受国际援助的唯一陆路运输线。

3. 2014年昆明火车站暴力恐怖袭击事件:
2014年3月1日21时在昆明火车站发生的一宗以阿不都热依木·库尔班为首，东突恐怖分子组织策划的砍杀无辜平民的恐怖袭击事件。
此案共造成平民31人死亡、141人受伤。3月3日下午，官方宣布破案，作案团伙共8人，5名直接参与袭击者中4人被当场击毙，1人被当场击伤抓获，其余3名策划者早于2月27日在云南省红河州个旧市沙甸镇被拘捕。
同年9月12日，此案由云南省昆明市中级人民法院审理完毕并宣判。