岩户铃芽是一名16岁少女，和阿姨住在九州宫崎县。她常梦见儿时的自己。2023年9月25日，铃芽在上学途中遇到一名寻“门”的青年草太。她跟随草太到废墟，发现一扇破旧的门，打开后看到梦中出现的天空。她捡起一座猫型石像，猫逃走后，铃芽发现学校发生地震，草太正在关闭被异力推动的“门”。铃芽协助草太，最终他用钥匙锁上门，异力随之消失。
草太告诉铃芽，他是负责关闭连接亡者世界“常世”的“往门”的闭门师，目的是防止巨大力量“蚓厄”现身。铃芽和草太在家中遇见一只会说话的小白猫，猫称自己叫“大臣”，随后逃走。铃芽和草太追随猫，乘渡轮到达四国。在蜜柑果园，他们遇见同龄的千果，并发现大山浮现异样烟雾。铃芽依照草太的指示关上往门，之后他们在千果家借宿。
次日，铃芽和草太乘车前往神户，期间遇到酒馆老板瑠美，帮助照看她的双胞胎。大臣被发现后逃出，铃芽在游乐园关上往门。她在社交媒体上找到大臣的踪迹，搭新干线前往东京，发现草太的朋友在找他。地震警报响起，蚓厄出现，草太意识到另一颗“要石”松脱。铃芽痛苦地将草太刺向蚓厄以解除危机。
铃芽决定通过唯一的门进入常世寻找草太。她与环、芹泽和大臣一起前往东北老家，铃芽找到日记和“门”的位置。进入常世后，铃芽和草太联手，最终将蚓厄镇住。铃芽与儿时的自己见面，鼓励她好好成长。返回现实后，铃芽与草太重逢，感慨“欢迎回来”。故事在她们回归日常生活中结束。
