新加坡共有大小岛屿63个，地势起伏和缓，主岛新加坡岛的面积占到90%以上。于北部建有新柔长堤，西部有第二通道，两者成为新加坡与马来西亚柔佛间的通联系道。新加坡岛以外较大的有岛屿裕廊岛、德光岛、乌敏岛及圣淘沙，地理最高点为武吉知马，海拔163.63米（537英尺）。
新加坡很多国土都是填海产生，建国后曾经进行多次填海工程。至2013年3月，填海土地面积达到逾13,000公顷，占据新加坡原有国家土地面积达约1/4。1950年至今，约20%的国土面积由填海产生，新加坡国土面积于1960年代时为581.5平方千米（224.5平方英里），现在约为728平方千米（281平方英里），至2030年以前，将会增加100平方千米（40平方英里），部分计划则连结比较小的岛屿，包括裕廊岛。尽管都市化缩减了雨林面积，但新加坡仍约有23%的国土属于森林或自然保护区，森林主要分布于武吉知马自然保护区。新加坡在城市绿化方面相当成功，境内共有逾300座公园及4个自然保护区，有“花园城市”之称。
新加坡未采行夏时制，新加坡标准时间为UTC+8，较其地理位置时区快1小时。
新加坡地处热带，长年受赤道低压带控制，为赤道多雨气候，长夏无冬，气温年温差和日温差小，年平均温度在24摄氏度至34摄氏度之间：最冷月为1月，受来自中国的东北季风影响，加上低压带的南移，较干燥的东北风会令新加坡的平均低温徘徊在摄氏23至24度左右。在此期间，新加坡的天气也会比较好；而到了4月至5月这段期间，在低压带的北移和东亚大陆高压带的减弱的影响下，气温会有轻微回升，而且雨量也会增多，湿度较高，每日平均相对湿度早上为79%，下午为73%。降雨充足，也常有雷暴，年均降雨量在2,400毫米左右，每年11月到1月为雨季，受较潮湿的季风影响，雨水较多。而每年的6月至9月，吹西南季候风，较为干燥少雨。
新加坡是个靠近印尼的国家，由于印尼经常地震，因此新加坡也不时有余震。2007年9月印尼苏门答腊发生8级地震，全新加坡有震感。2016年3月，印尼苏门答腊西南发生7.8级地震，之后新加坡开始有震感。2016年6月，印尼苏门答腊6.5级地震，全新加坡确定有感受到地震的地区包括榜鹅、蔡厝港、宏茂桥、大巴窑、武吉班让、黄埔、实乞纳、马林百列、花拉公园、盛港等，只剩东部地区没有传来感受到地震的消息。